Yıl 2018, Cilt 7, Sayı 1, Sayfalar 1 - 11 2018-02-28

SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU

Mehmet Burçin Mutlu [1] , Seval Çınar [2]

153 196

Bu çalışmada Sivas’ta bulunan farklı solar tuzlalardan halofilik mikroorganizmaların izolasyonu yapılmıştır ve elde edilen izolatların 16S rRNA gen analizine dayalı karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. İzolasyon işlemi farklı tuz konsantrasyonları ile hazırlanmış 5 farklı besiyeri ile gerçekleştirilmiştir. Morfolojik olarak farklılık gösteren kolonilerin 16S rRNA genleri ARDRA ile analiz edilmiştir ve kesim profilleri karşılaştırılmıştır. 47 adet suş tanımlama amacıyla seçilmiştir. Bacteria domaini içerisinde yer alan izolatların Idiomarina, Salinivibrio, Halomonas, Salinibacter, Gracilibacillus, Thalassobacillus, Aliifodinibius, Chromohalobacter, Planococcus, Marinobacter, Bacillus, Aquisalimonas, Marinococcus, Alkalibacillus, Kangiella ve Microbulbifer cinsleri ile filogenetik olarak ilişkili olduğu saptanmıştır. Halofilik arke izolatları ise Haloferax, Natrinema, Haloterrigena, Halopelagius, Halorhabdus ve Haloarcula cinsleri içerisinde dağılım göstermiştir.

Halofilik Mikroorganizmalar, Solar Tuzlalar
  • [1] Oren A. Diversity of halophilic microorganisms: environments, phylogeny, physiology, and applications. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 2002; 28:56-63.
  • [2] Oren A. Industrial and environmental applications of halophilic microorganisms. Environmental Technology 2010; 31:825-834.
  • [3] Antón J., Rosselló-Mora R., Rodríguez-Valera F., Amann R. Extremely halophilic bacteria in crystallizer ponds from solar salterns. Applied and Environmental Microbiology 2000; 66:3052-3057.
  • [4] Burns D.G., Camakaris H.M., Janssen P.H., Dyall-Smith M.L. Combined use of cultivation-dependent and cultivation-independent methods indicates that members of most haloarchaeal groups in an Australian crystallizer pond are cultivable. Applied and Environmental Microbiology 2004; 70:5258-5265
  • [5] Baati H., Guermazi S., Amdouni R., Gharsallah N., Sghir A., Ammar E. Prokaryotic diversity of a Tunisian multipond solar saltern. Extremophiles 2008; 12:505-518.
  • [6] Taşman C.E. Tuzlarımız. MTA Dergisi 1945; 33:105-108.
  • [7] Ergin Z. Tuzun üretim teknolojisi ve insan sağlığındaki yeri. Madencilik Dergisi 1988; 27:21-30.
  • [8] Stchepinsky V. Sivas Vilâyeti İdrokarbürleri, Liğnitleri ve Tuzlu Menbaları, MTA Dergisi 1939; 4:88-94
  • [9] Yazıcı H., Başıbüyük A., Altınbilek S. Kemah (Erzincan) Tuzlaları. Türk Coğrafya Dergisi 1998; 33:53-78
  • [10] Rodrı́guez-Valera F., Ventosa A., Juez G., Imhoff J.F. Variation of environmental features and microbial populations with salt concentrations in a multi-pond saltern. Microbial Ecology 1985; 11:107-115.
  • [11] Oren A. Estimation of the contribution of halobacterial to the bacterial biomass and activity in solar salterns by the use of bile salts. FEMS Microbiology Ecology 1990; 6:41-47.
  • [12] Dyall-Smith M.L. The Halohandbook- Protocols for Haloarchaeal Genetics, Version 7.2, 2009; (http://www.haloarchaea.com/resources/halohandbook /index.html).
  • [13] DeLong E.F. Archaea in coastal marine environments. Proceedings of the National Academy of Sciences 1992; 89:5685-5689.
  • [14] Lane D. J., Pace B., Olsen G.J., Stahl D.A., Sogin M.L., Pace N.R. Rapid determination of 16S ribosomal RNA sequences for phylogenetic analyses. Proceedings of the National Academy of Sciences 1985; 82:6955-6959.
  • [15] Dereeper A., Audic S., Claverie J.M., Blanc G. BLAST-EXPLORER helps you building datasets for phylogenetic analysis. BMC Evolutionary Biology 2010; 10:8.
  • [16] Dereeper A., Guignon V., Blanc G., Audic S., Buffet S., Chevenet F., Dufayard J.F., Guindon S., Lefort V., Lescot M. et al. Phylogeny.fr: robust phylogenetic analysis for the non-specialist. Nucleic Acids Research 2008; 36:W465-W469
  • [17] Edgar R.C. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research 2004; 32:1792-1797.
  • [18] Yaşa İ., Kahraman Ö., Tekin E., Koçyiğit A. Çamaltı Tuzlasından Ekstrem Halofilik Archaea İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu. E.Ü. Su Ürünleri Dergisi 2008; 2:117-121.
  • [19] Mutlu M.B., Güven K. Bacterial Diversity in Çamaltı Saltern, Turkey. Polish Journal of Microbiology 2015; 64:37-45.
  • [20] Elevi R., Assa P., Birbir M., Ogan A., Oren A. Characterization of extremely halophilic Archaea isolated from the Ayvalik Saltern, Turkey. World Journal of Microbiology and Biotechnology 2004; 20:719-725.
  • [21] Birbir M., Calli B., Mertoglu B., Bardavid R.E., Oren A., Ogmen M.N., Ogan A. Extremely halophilic Archaea from Tuz Lake, Turkey, and the adjacent Kaldırım and Kayacık salterns. World Journal of Microbiology and Biotechnology 2007; 23:309-316.
  • [22] Viver T., Cifuentes A., Díaz S., Rodríguez-Valdecantos G., González B., Antón J., Rosselló-Móra R. Diversity of extremely halophilic cultivable prokaryotes in Mediterranean, Atlantic and Pacific solar salterns: evidence that unexplored sites constitute sources of cultivable novelty. Systematic and Applied Microbiology 2015; 38:266-275.
  • [23] Sabet S., Diallo L., Hays L., Jung W., Dillon J.G. Characterization of halophiles isolated from solar salterns in Baja California, Mexico. Extremophiles 2009; 13:643-656.
  • [24] Maturrano L., Santos F., Rosselló-Mora R., Antón J. Microbial diversity in Maras salterns, a hypersaline environment in the Peruvian Andes. Applied and Environmental Microbiology 2006; 72:3887-3895.
  • [25] Çınar S., Mutlu M.B. Comparative analysis of prokaryotic diversity in solar salterns in eastern Anatolia (Turkey). Extremophiles 2016; 20:589-601.
  • [26] Burns D.G., Janssen P.H., Itoh T., Kamekura M., Li Z., Jensen G., Rodrı́guez-Valera F., Bolhuis H., Dyall-Smith, M.L. Haloquadratum walsbyi gen. nov., sp. nov., the square haloarchaeon of Walsby, isolated from saltern crystallizers in Australia and Spain. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 2007; 57:387-392.
  • [27] Enache M., Itoh T., Kamekura M., Teodosiu G., Dumitru L. Haloferax prahovense sp. nov., an extremely halophilic archaeon isolated from a Romanian salt lake. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 2007; 57:393-397.
  • [28] Caton T.M., Witte L.R., Ngyuen H.D., Buchheim J.A., Buchheim M.A., Schneegurt M.A. Halotolerant aerobic heterotrophic bacteria from the Great Salt Plains of Oklahoma. Microbial Ecology 2004; 48:449-462.
Birincil Dil tr
Konular Yaşam Bilimleri
Dergi Bölümü Araştırma Makalesi
Yazarlar

Yazar: Mehmet Burçin Mutlu
E-posta: mbmutlu@anadolu.edu.tr
Kurum: Anadolu Üniversitesi
Ülke: Turkey


Yazar: Seval Çınar
E-posta: svlcinar@gmail.com
Kurum: Anadolu Üniversitesi
Ülke: Turkey


Bibtex @araştırma makalesi { aubtdc305855, journal = {Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji}, issn = {2146-0264}, address = {Anadolu Üniversitesi}, year = {2018}, volume = {7}, pages = {1 - 11}, doi = {10.18036/aubtdc.305855}, title = {SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU}, key = {cite}, author = {Çınar, Seval and Mutlu, Mehmet Burçin} }
APA Mutlu, M , Çınar, S . (2018). SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU. Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji, 7 (1), 1-11. DOI: 10.18036/aubtdc.305855
MLA Mutlu, M , Çınar, S . "SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU". Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji 7 (2018): 1-11 <http://dergipark.gov.tr/aubtdc/issue/31126/305855>
Chicago Mutlu, M , Çınar, S . "SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU". Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji 7 (2018): 1-11
RIS TY - JOUR T1 - SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU AU - Mehmet Burçin Mutlu , Seval Çınar Y1 - 2018 PY - 2018 N1 - doi: 10.18036/aubtdc.305855 DO - 10.18036/aubtdc.305855 T2 - Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji JF - Journal JO - JOR SP - 1 EP - 11 VL - 7 IS - 1 SN - 2146-0264-2146-0213 M3 - doi: 10.18036/aubtdc.305855 UR - http://dx.doi.org/10.18036/aubtdc.305855 Y2 - 2017 ER -
EndNote %0 Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU %A Mehmet Burçin Mutlu , Seval Çınar %T SİVAS’IN SOLAR TUZLALARINDAKİ MİKROBİYAL TOPLULUKLARIN KÜLTÜR-BAĞIMLI KARAKTERİZASYONU %D 2018 %J Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi - C Yaşam Bilimleri Ve Biyoteknoloji %P 2146-0264-2146-0213 %V 7 %N 1 %R doi: 10.18036/aubtdc.305855 %U 10.18036/aubtdc.305855